Operative Leitung der Core Unit „Bioinformatik, Datenintegration und -Analyse (CUBiDA)“ (m/w/d)
Medizinisches IK-Zentrum
Herrn Martin Schneider
Krankenhausstraße 12
91054 Erlangen
Dr. Detlef Kraska
Telefon: 09131 85-46400
Job-Id: 8148
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Herrn Martin Schneider
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Published since: 06.05.2024
Job-Id: 8148
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Who we are:
Das Medizinische Zentrum für Informations- und Kommunikationstechnik erbringt als zentrale Serviceeinrichtung des Uniklinikums Erlangen (UKER) Dienstleistungen auf dem Gebiet der Informations- und Kommunikationstechnik. Die Abteilung „IT für Forschung und Management“ (IFM) befasst sich mit der IT-Unterstützung von Forschung, Lehre und Management am Klinikum und an der Medizinischen Fakultät. Unter dem Dach von IFM und in Kooperation mit dem Lehrstuhl für Medizinischen Informatik der Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg (FAU) wird seit 2021 die Core Unit „Bioinformatik, Datenintegration und -Analyse (CUBiDA)“ aufgebaut. Im Rahmen der nächsten Förderphase sucht das MIK eine neue operative Leitung für die CUBiDA. Nach der initialen Aufbauphase wird der Fokus nun auf der Koordination und Vernetzung der bereits vorhandenen Kompetenzen und Ressourcen an der FAU und dem UKER sowie auf der Einrichtung einer zentralen Anlaufstelle für Forschende am UKER und der FAU liegen.
Die Aufgaben
- Vernetzung mit anderen Institutionen und Personen, die gleichfalls im Bereich der klinischen Bioinformatik und der Datenintegration tätig sind, u.a. zur Etablierung der Core Unit als zentrale Anlaufstelle
- Weiterentwicklung des Dienstleistungsangebots der CUBiDA
- Einwerben von Drittmitteln, u.a. über die Mitarbeit bei der Erstellung neuer Forschungsanträge
- Planung und Durchführung von Kolloquien und Workshops z.B. für Nachwuchsgruppen
- Koordinierung und Unterstützung der Analyseanfragen von Forschern, welche ein breites Spektrum von einfachen Excel-Berechnungen bis hochkomplexe, mehrere Omics-Ebenen beinhaltende, bioinformatischen Auswertungen umfassen, insbesondere z.B. auch:
- NGS-Pipelines
- Integration von molekularbiologischen Daten mit klinischen Daten in translationalen Forschungsplattformen wie cBioPortal
- Anreicherung und Zusammenführung von experimentellen Daten der Forscher mit Daten aus öffentlichen, bioinformatischen Datenbanken wie TCGA oder GEO.
Das Know-how dafür
- Abgeschlossenes Hochschulstudium oder idealerweise Promotion im Bereich der Bioinformatik, Molekularbiologie, Medizinischen Informatik, Medical Data Science oder vergleichbarer Fachrichtung
- Praktische Programmiererfahrung, vor allem in der Verarbeitung molekularbiologischer Daten
- Gute Kenntnisse im Bereich der Mathematik/Statistik
- Gute Deutsch- und Englischkenntnisse
Zusätzlich von Vorteil
- Wünschenswert ist Erfahrung beim Leiten von Teams
- Wünschenswert ist Erfahrung mit der Erstellung von Projekt- bzw. Forschungsanträgen (z. B. Drittmittelprojekte)
- Wünschenswert ist Erfahrung bei der Koordination von multidisziplinären und Institutsübergreifenden Forschungsprojekten
- Wünschenswert ist ein offenes und kommunikatives „kundenorientiertes“ Auftreten